SMK Negeri 1 Sentani berdiri berdasarkan SK Menteri Pendidikan dan Kebudayaan No.001a/O/1999 tanggal 5 Januari 1999 diatas tanah seluas 3 hektar, dan Nomor Statistik Sekolah 33.1.25.01.02.001.
Pada awalnya membuka 2 Bidang Keahlian yaitu Teknik Bangunan dan Teknik Mesin. Namun sejalan dengan perkembangan kebutuhan dunia kerja, saat ini telah berkembang menjadi 4 Bidang Keahlian dan 10 Program Keahlian. Bidang Keahlian yang dikembangkan oleh SMK Negeri 1 Sentani selalu dikaji dan disesuaikan dengan kebutuhan lapangan kerja, serta permintaan dunia industri lokal. Para siswa baru juga diberikan kebebasan untuk memilih Bidang Keahlian yang sesuai dengan kemampuan dan potensi diri mereka.
